金融服务“三农”，最大的难点在于农业贷款的信用担保力量相对薄弱。为此，上海率先在农业贷款担保机制上进行了创新。首先就是加大了财政担保力度，财政杠杆向农业倾斜。

上海金融机构还通过“银保联合”等创新贷款信用保证保险新品种。如由上海安信农保提供农民专业合作社信用保证保险，农村商业银行提供农民专业合作社专项贷款。市农委和农商行还共同研究制定农民专业合作社信用等级评定办法，对守信农民专业合作社试行发放信用贷款。商业银行还创新支农金融服务品种，将信贷服务范围扩展到农户的农业生产贷款需求，并采取抵押、质押、小组联保、个人无限责任等担保方式或信用卡方式为农户提供贷款服务。

金融机构服务“三农”的贷款风险降低了，服务“三农”的积极性则大大提高。近年来，上海已初步形成了以农村商业银行、中国农业银行市分行和中国农业发展银行市分行为主体，以其他金融机构为补充的农村金融体系。